RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DNASE1L2Q92874 299 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SGK2Q9HBY8 427 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 COX7A2P14406 83 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ELP6Q0PNE2 266 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK11Q15759 364 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF404Q494X3 552 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 P3H2Q8IVL5 708 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 NXPE3Q969Y0 559 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 C7orf34Q96L11 122 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 COQ10AQ96MF6 247 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 C5orf42Q9H799 3197 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 K7ESM1 405 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 UPK1BO75841 260 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 LAMP1P11279 417 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HNF4AP41235 474 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP8Q86W28 1048 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 DTD2Q96FN9 168 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 COPS4Q9BT78 406 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF4O00268 1085 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 TLL1O43897 1013 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 AIREO43918 545 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 LIPAP38571 399 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 C21orf58P58505 322 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDH1Q08174 1060 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SCAIQ8N9R8 606 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 TPD52L3Q96J77 140 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 POLE4Q9NR33 117 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF6Q9Y252 685 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PRRT4C9JH25 899 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HLA-EP13747 358 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINB1P30740 379 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXD12P35452 270 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 FPGSQ05932 587 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 MLIPQ5VWP3 458 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 OR7G3Q8NG95 312 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 NEIL2Q969S2 332 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD11Q96NU1 681 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 A3GALT2U3KPV4 340 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ10P78508 379 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SYT16Q17RD7 645 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 LYSMD2Q8IV50 215 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 MYDGFQ969H8 173 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 BRF2Q9HAW0 419 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PCM1Q15154 2024 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 METTL15A6NJ78 407 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMD11O00231 422 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 LILRB5O75023 590 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 C1orf105O95561 183 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 VIPR2P41587 438 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ST8SIA6P61647 398 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF480Q8WV37 535 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 STARD8Q92502 1023 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 BADQ92934 168 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 CHST8Q9H2A9 424 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BM21 787 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 PLK4O00444 970 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 SUV39H1O43463 412 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-201ENST00000369862 HSD3B1P14060 373 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms