RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MYNNQ9NPC7 610 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LRIT2A6NDA9 550 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CLEC3AO75596 197 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SEMA3DO95025 777 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CCNDBP1O95273 360 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 UGT2B7P16662 529 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MAGP20916 626 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SERPINB1P30740 379 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SLC14A1Q13336 389 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SLCO4A1Q96BD0 722 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 VCXQ9H320 206 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SPASTQ9UBP0 616 aa20.18■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0G2JNG1 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 C4orf51C9J302 202 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 STAMBPO95630 424 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 FURINP09958 794 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 VHLP40337 213 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 HYAL2Q12891 473 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KIR2DS5Q14953 304 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SPATS1Q496A3 300 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LPCAT4Q643R3 524 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LILRA2Q8N149 483 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LMX1AQ8TE12 382 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 STARD8Q92502 1023 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 COQ8BQ96D53 544 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SNX7Q9UNH6 387 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0C4DFX4 3053 aa20.17■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PRAMEF10O60809 474 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 HRH2P25021 359 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 HHEXQ03014 270 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KIR2DS3Q14952 304 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LCN8Q6JVE9 175 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PAQR7Q86WK9 346 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 RGMAQ96B86 450 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ABCG4Q9H172 646 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 OR5K4A6NMS3 321 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 TMPRSS11DO60235 418 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 HTR1EP28566 365 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MAPK12P53778 367 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1CAP62136 330 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZIC1Q15915 447 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 MPEG1Q2M385 716 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CAMKMTQ7Z624 323 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.16■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZW10O43264 779 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 SDC3O75056 442 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 POLE2P56282 527 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 TTLQ8NG68 377 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 OR2T12Q8NG77 320 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PPCDCQ96CD2 204 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 IMPDH2P12268 514 aa20.15■□□□□ 0.82
RFXAP-201ENST00000255476 PVRP15151 417 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms