RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CDH13P55290 713 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 HERVK_113P63132 956 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OLR1P78380 273 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZNF844Q08AG5 666 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CHAF1BQ13112 559 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 FAM219BQ5XKK7 198 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 GAL3ST3Q96A11 431 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 F2RL3Q96RI0 385 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MS4A8Q9BY19 250 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ING2Q9H160 280 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ACTR8Q9H981 624 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 P4HTMQ9NXG6 502 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 C3orf18Q9UK00 162 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 NUP210LQ5VU65 1888 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR2W5A6NFC9 320 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 URADA6NGE7 173 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 IDSB3KWA1 339 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CHST10O43529 356 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TAC1P20366 129 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 IMPDH1P20839 514 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 XCR1P46094 333 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CCT5P48643 541 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ABHD17CQ6PCB6 329 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 BANPQ8N9N5 519 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 HUS1BQ8NHY5 278 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A7Q92504 469 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CCT6BQ92526 530 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 UBE2E3Q969T4 207 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CRB3Q9BUF7 120 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PRDM7Q9NQW5 492 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 LANCL2Q9NS86 450 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JN53 185 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ERI3O43414 337 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CLDN9O95484 217 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CREB1P16220 341 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN8P19075 237 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 EMP2P54851 167 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 BTN3A2P78410 334 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 RUNX2Q13950 521 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR2L5Q8NG80 312 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PEX11GQ96HA9 241 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 IP6K3Q96PC2 410 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 VN1R1Q9GZP7 353 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MKS1Q9NXB0 559 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 K7EM74 188 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 AGPSO00116 658 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 COPEO14579 308 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TGFB1P01137 390 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 IGHEP01854 428 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PCNAP12004 261 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PIK3CBP42338 1070 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CCNG1P51959 295 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CLCQ05315 142 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CCDC153Q494R4 210 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TMEM205Q6UW68 189 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MED25Q71SY5 747 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 AMER2Q8N7J2 671 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR11G2Q8NGC1 345 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZIM3Q96PE6 472 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ADNPQ9H2P0 1102 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.04■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CFAP46Q8IYW2 2715 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ72 361 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM4O75871 244 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 NEK2P51955 445 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G16P53816 162 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 KCNAB2Q13303 367 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 DCAF10Q5QP82 559 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 DEPDC1Q5TB30 811 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 LETMD1Q6P1Q0 360 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CA13Q8N1Q1 262 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 C8orf44Q96CB5 159 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ABHD17AQ96GS6 310 aa21.03■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 OR1F2PQ96R84 312 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms