RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 MYOCQ99972 504 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CREB5Q02930 508 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 BATFQ16520 125 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TSPEARQ8WU66 669 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 NUAK1O60285 661 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 MSCO60682 206 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CKMT1AP12532 417 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PNCKQ6P2M8 343 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 C5orf34Q96MH7 638 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZNF382Q96SR6 550 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 HTR2AP28223 471 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 GRHL3Q8TE85 626 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.832e-8■□□□□ 10
TTL-201ENST00000233336 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ASB3Q9Y575 518 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 BMP2P12643 396 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 GDF5P43026 501 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 BORCS6Q96GS4 357 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TLE6Q9H808 572 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 COQ8BQ96D53 544 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SRCP12931 536 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 COMTD1Q86VU5 262 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 UPK1BO75841 260 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 HTR1EP28566 365 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 LRRC72A6NJI9 287 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SPATA31D3P0C874 917 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 GPR151Q8TDV0 419 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CCDC32Q9BV29 185 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 DNASE1P24855 282 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 OR3A3P47888 321 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 OR3A2P47893 321 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 STC1P52823 247 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ARVCFO00192 962 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 E2F1Q01094 437 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 ZNF384Q8TF68 577 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 RGMAQ96B86 450 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SHISA4Q96DD7 197 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 LMLNQ96KR4 655 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 REEP3Q6NUK4 255 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 VIPP01282 170 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PSMD8P48556 350 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 LCN8Q6JVE9 175 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 KCTD3Q9Y597 815 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 IRAK2O43187 625 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 PI15O43692 258 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 MT-ND5P03915 603 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 GABRR2P28476 465 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 DGKGP49619 791 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 FZD8Q9H461 694 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TVP23AA6NH52 213 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 OIP5O43482 229 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 RAB3BP20337 219 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 MPIP34949 423 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 CPQQ9Y646 472 aa9.86□□□□□ -0.83
TTL-201ENST00000233336 FAM170BA6NMN3 283 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms