RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 AOAHP28039 575 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CETN2P41208 172 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCZ1BP86790 482 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PLGLB1Q02325 96 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KIF18BQ86Y91 864 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SMPDL3BQ92485 455 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PERPQ96FX8 193 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CARD6Q9BX69 1037 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 AMFRQ9UKV5 643 aa15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RDH16O75452 317 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FTCDO95954 541 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GABRA1P14867 456 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA5P43359 124 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 P3H1Q32P28 736 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 WLSQ5T9L3 541 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PEX26Q7Z412 305 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PDSS2Q86YH6 399 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PLD3Q8IV08 490 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM156Q8N614 296 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SARAFQ96BY9 339 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC45Q96CN5 670 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OR1F2PQ96R84 312 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.24■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 F8W8V4 182 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SUSD5O60279 629 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJB6O75190 326 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ITGA10O75578 1167 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CELA3AP09093 270 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCNFP41002 786 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DMTNQ08495 405 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC38Q502W7 563 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ICE2Q659A1 982 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1328Q86T90 577 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KRT222Q8N1A0 295 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PEX11GQ96HA9 241 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 HES6Q96HZ4 224 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TAC3Q9UHF0 121 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NINQ8N4C6 2090 aa15.23■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NID1P14543 1247 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MAN2A2P49641 1150 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TMED2Q15363 201 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SMPDL3AQ92484 453 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1191Q96A73 305 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC138Q96M89 665 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DESI2Q9BSY9 194 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.22■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CES2O00748 559 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD3O43242 534 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN12O43309 604 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 IL10P22301 178 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF136P52737 540 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ACVR1Q04771 509 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF534Q76KX8 674 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms