RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028386.11

Nckap1-201, Transcript of Nck-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nckap1, Length 4,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ankra2Q99PE2 312 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 SelenosQ9BCZ4 190 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Adck1Q9D0L4 525 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Izumo2Q9DA16 220 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Psmg2Q9EST4 264 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tdp2Q9JJX7 370 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ech1O35459 327 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fkbp7O54998 218 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tbpl1P62340 186 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Glb1l2Q3UPY5 636 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nxf3Q4ZGD9 553 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 CmahQ61419 577 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tas2r104Q7M723 302 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf750Q8BH05 703 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rcor1Q8CFE3 480 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nudt7Q99P30 236 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cypt12Q9DAR6 119 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hmgn3Q9DCB1 99 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp14P10755 501 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lman2lP59481 347 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rsrp1Q3UC65 298 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pydc3Q3V3Q4 588 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr594Q7TRR4 311 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Frs2Q8C180 508 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gin1Q8K259 518 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Timd2Q8R183 305 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hcar2Q9EP66 360 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Prl5a1Q9JII2 230 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Acot2Q9QYR9 453 aa20.38■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm16427J3QN52 483 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Entpd2O55026 495 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dmp1O55188 503 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 DctP29812 517 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 SnnP61807 88 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rps3P62908 243 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Reps2Q80XA6 521 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nkiras2Q9CR56 191 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam43bA2AM80 330 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm3239L7N2D9 227 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Q3U4G0 281 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Runx3Q64131 409 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cd34Q64314 382 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp180Q6NZI9 655 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Asb2Q8K0L0 634 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kiaa2013Q91X21 634 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sh3d19Q91X43 789 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ttc25Q9D4B2 624 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rhox9Q9EQM5 227 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm6619F6URP1 175 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp324Q78F42 583 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 FggQ8VCM7 436 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr683Q8VGV1 319 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Stk19Q9JHN8 254 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 ApoeP08226 311 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Igfbp2P47877 305 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc45a4Q0P5V9 785 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc30a10Q3UVU3 470 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc39a10Q6P5F6 833 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 NrmQ8VC65 262 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cant1Q8VCF1 403 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mri1Q9CQT1 369 aa20.37■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr618K7N6B3 318 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ggta1P23336 394 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Naf1Q3UMQ8 489 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc2a12Q8BFW9 622 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cacnb2Q8CC27 655 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ccdc71Q8VEG0 433 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 OgfrQ99PG2 633 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rnf128Q9D304 428 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cd300ld2A2A7W0 305 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Spaca5A2AE20 160 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Smad6O35182 495 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AhcyP50247 432 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Osbp2Q5QNQ6 908 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Prkg2Q61410 762 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpr1Q8K087 353 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Krt88Q9CPR6 171 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mocs2Q9Z223 189 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 TomtA1Y9I9 258 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vmn2r61L7N2B8 865 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Phkg1P07934 388 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Taar7dQ5QD10 358 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 PianpQ6P1B3 278 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Spata2lQ8BNN1 426 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23 ms