RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 FOXN2P32314 431 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PTGER3P43115 390 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DSC3Q14574 896 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SVBPQ8N300 66 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARID1AO14497 2285 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SCNN1AP37088 669 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRT-209ENST00000612229 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ELOA3Q8NG57 546 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GLUD2P49448 558 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRT-209ENST00000612229 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PAOXQ6QHF9 649 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 EPGNQ6UW88 154 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PIGZQ86VD9 579 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 XYLT1Q86Y38 959 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CMKLR1Q99788 373 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RNF212BA8MTL3 300 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ESR1P03372 595 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GNSP15586 552 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PRKXP51817 358 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GBE1Q04446 702 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF460Q14592 562 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PYURFQ96I23 114 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CASP6P55212 293 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF92Q03936 586 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MAL2Q969L2 176 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SCN9AQ15858 1988 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A8MX80 341 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GNB3P16520 340 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PBX3P40426 434 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 CDT1Q9H211 546 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CTNNB1P35222 781 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NAE1Q13564 534 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 BEND4Q6ZU67 534 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD46Q86W74 232 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 STK35Q8TDR2 534 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMBIM1Q969X1 311 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ACDQ96AP0 544 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP14A8MT82 685 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL1O75677 317 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OLFM2O95897 454 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PRNPP04156 253 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 GPR21Q99679 349 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 FADS1O60427 444 aa6.77□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 CD6P30203 668 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IKBKEQ14164 716 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CD180Q99467 661 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 WACQ9BTA9 647 aa6.77□□□□□ -1.33
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