RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592275.5

USP36-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 4

Gene USP36, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-222	ENST00000592275	MLF1	P58340	268 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NAE1	Q13564	534 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HERC3	Q15034	1050 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	OR56A3	Q8NH54	315 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NDN	Q99608	321 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	OLFM1	Q99784	485 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SLC16A5	O15375	505 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CEP104	O60308	925 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ZNF24	P17028	368 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PTGER1	P34995	402 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TAS2R50	P59544	299 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	OLR1	P78380	273 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HYAL2	Q12891	473 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NT5C	Q8TCD5	201 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	AICDA	Q9GZX7	198 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NDC80	O14777	642 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NDUFS4	O43181	175 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CHST10	O43529	356 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ABO	P16442	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ALOX12	P18054	663 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CXCR5	P32302	372 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CDKN2D	P55273	166 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	BTG2	P78543	158 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	REEP5	Q00765	189 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PWP1	Q13610	501 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	KRT38	O76015	456 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CAPN3	P20807	821 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	JAK1	P23458	1154 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	GRK3	P35626	688 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	SCTR	P47872	440 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	RGS4	P49798	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	HLCS	P50747	726 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CCR8	P51685	355 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PGGT1B	P53609	377 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ITGA8	P53708	1063 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	TFF3	Q07654	80 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CRYM	Q14894	314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-222	ENST00000592275	PYCR2	Q96C36	320 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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