RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588552.5

PTPRS-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRS, Length 5,443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-206ENST00000588552 TSPEARQ8WU66 669 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CD320Q9NPF0 282 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 IL26Q9NPH9 171 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MCUBQ9NWR8 336 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SCML1Q9UN30 329 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PEX12O00623 359 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 HOXC12P31275 282 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FMO3P31513 532 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MNDAP41218 407 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 DSC1Q08554 894 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 GIN1Q9NXP7 522 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 UBE2QL1A1L167 161 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 AIREO43918 545 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 DRD1P21728 446 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 RHDQ02161 417 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 TGM7Q96PF1 710 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 IL17CQ9P0M4 197 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 ST3GAL3Q11203 375 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SGCBQ16585 318 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 LIN52Q52LA3 116 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 RNF220Q5VTB9 566 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 C12orf40Q86WS4 652 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 RAB8BQ92930 207 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 DAPL1A0PJW8 107 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 IDH3BO43837 385 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PRKAR1AP10644 381 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 BCKDHAP12694 445 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 REEP3Q6NUK4 255 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 MOAP1Q96BY2 351 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 WDR45Q9Y484 360 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SNPHO15079 494 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 HEXBP07686 556 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 NR4A1P22736 598 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 MTTPP55157 894 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 KRT74Q7RTS7 529 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 LINC00471Q8N535 108 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PDE7BQ9NP56 450 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 A0A0U1RQS6 177 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 FEZF1A0PJY2 475 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 ISCA2Q86U28 154 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 NANOGQ9H9S0 305 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 FAM170BA6NMN3 283 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 TLR4O00206 839 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 DUX1O43812 170 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 DIRAS1O95057 198 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 JMJD7P0C870 316 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SDC2P34741 201 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SLAMF1Q13291 335 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 DEFB134Q4QY38 66 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 F2RL3Q96RI0 385 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-206ENST00000588552 EPYCQ99645 322 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms