RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ISCA2Q86U28 154 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEATR4Q86WZ0 1026 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDHD1Q8NEL9 900 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFAP61Q8NHU2 1237 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SARAFQ96BY9 339 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIC2Q96JB3 615 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM237Q96Q45 408 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS35Q96QK1 796 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PANX3Q96QZ0 392 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDH19Q9H159 772 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PNPOQ9NVS9 261 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMOXQ9NWM0 555 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD274Q9NZQ7 290 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FIS1Q9Y3D6 152 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR1A2Q9Y585 309 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM202A6NGA9 273 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SYCE1LA8MT33 242 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM114B3SHH9 223 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TARM1B6A8C7 271 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLF11O14901 512 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCAMP1O15126 338 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAD51BO15315 384 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 YY2O15391 372 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPPED1O15442 326 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGTAO43765 313 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNX3O60493 162 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATG13O75143 517 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNNO75324 88 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDK14O94921 469 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP2A2O94973 939 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GUCA1CO95843 209 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSPAN12O95859 305 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHRNGP07510 517 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPBGLP0DKB5 382 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHRNB1P11230 501 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDCP20711 480 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD9P21926 228 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARRB2P32121 409 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACSL1P33121 698 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC26A3P40879 764 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGTR2P50052 363 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPMTP51580 245 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKAA2P54646 552 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDK3Q00526 305 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAPQ12884 760 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RCN2Q14257 317 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBBP7Q16576 425 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZSCAN26Q16670 478 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PNCKQ6P2M8 343 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KBTBD6Q86V97 674 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HORMAD1Q86X24 394 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPSM1Q86YR5 675 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.31□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1191Q96A73 305 aa5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms