RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PFAS	O15067	1338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A087X0K7	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SOCS2	O14508	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ARPC2	O15144	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HMMR	O75330	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HOXC6	P09630	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ETS1	P14921	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	JAK1	P23458	1154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ACP1	P24666	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GLIPR1	P48060	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PEX5	P50542	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KLC1	Q07866	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DMPK	Q09013	629 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RBBP7	Q16576	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ASPG	Q86U10	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PGM2	Q96G03	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NAPB	Q9H115	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LAMB1	P07942	1786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321		K7EPI3	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TLR4	O00206	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321		O00370	1275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SERPING1	P05155	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	AREG	P15514	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF12	P17014	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SFN	P31947	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ARRB2	P32121	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PHKG1	Q16816	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CST9	Q5W186	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	ALG14	Q96F25	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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