RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 ETHE1O95571 254 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 HTR1AP08908 422 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ADRB3P13945 408 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NPPBP16860 134 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 AGXTP21549 392 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PCMT1P22061 227 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PRKACGP22612 351 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 MAGEA8P43361 318 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 STT3AP46977 705 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PRIM2P49643 509 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GALK1P51570 392 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 KCNJ10P78508 379 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 VLDLRP98155 873 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 IL1RL1Q01638 556 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TAP2Q03519 686 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 C2orf80Q0P641 193 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NPRL3Q12980 569 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TMED1Q13445 227 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GAB1Q13480 694 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SCARB2Q14108 478 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GRIN2CQ14957 1233 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PDGFRLQ15198 375 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NPTX1Q15818 432 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 DGUOKQ16854 277 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 MLIPQ5VWP3 458 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 KLHL35Q6PF15 583 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CEP68Q76N32 757 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PDZD3Q86UT5 571 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 P3H2Q8IVL5 708 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PARP8Q8N3A8 854 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 RNF175Q8N4F7 328 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 FAR1Q8WVX9 515 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ARRDC3Q96B67 414 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TPD52L3Q96J77 140 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 C7orf34Q96L11 122 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 HDAC8Q9BY41 377 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NLNQ9BYT8 704 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 OR2AG1Q9H205 316 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 OCEL1Q9H607 264 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NT5DC2Q9H857 520 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 HMG20AQ9NP66 347 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GALNT8Q9NY28 637 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SPASTQ9UBP0 616 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 GULP1Q9UBP9 304 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ICKQ9UPZ9 632 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PTGES3LE9PB15 166 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 MPZL2O60487 215 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PAPLNO95428 1278 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 B3GALT4O96024 378 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SOD1P00441 154 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 INHBBP09529 407 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ARAFP10398 606 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ERGP11308 486 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 EPCAMP16422 314 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 UQCRC2P22695 453 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 ACADLP28330 430 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 TEAD1P28347 426 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 PDHA2P29803 388 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CRATP43155 626 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CDK6Q00534 326 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 FPGSQ05932 587 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-205ENST00000546891 C16orf87Q6PH81 154 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms