RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 AP5B1Q2VPB7 878 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA21Q7Z572 469 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 BMPERQ8N8U9 685 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 NT5CQ8TCD5 201 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 BRF2Q9HAW0 419 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PLPP1O14494 284 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB6O75190 326 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC22BO75396 215 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SPTBP11277 2137 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PWP1Q13610 501 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PRTGQ2VWP7 1150 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB11FIP2Q7L804 512 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC45A3Q96JT2 553 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CMKLR1Q99788 373 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 EBPLQ9BY08 206 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 LRTM1Q9HBL6 345 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 LHX9Q9NQ69 397 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 E9PBE3 544 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL41O60662 606 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 IL1RNP18510 177 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CHSY3Q70JA7 882 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM122AQ96E09 287 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf90Q96M02 699 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 STRADBQ9C0K7 418 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PIEZO1Q92508 2521 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX3O60493 162 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 EEDO75530 441 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP1GDS1P52306 607 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ARFIP2P53365 341 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK10P53779 464 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGA1P56199 1179 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL38P63173 70 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ACY1Q03154 408 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB134Q4QY38 66 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf136Q5SQH8 315 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf82Q8WW14 230 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RILPQ96NA2 401 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINI1Q99574 410 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PISDQ9UG56 409 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 HYKKA2RU49 373 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF749O43361 778 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINB1P30740 379 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 BTN3A2P78410 334 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ADPRMQ3LIE5 342 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 OR8K5Q8NH50 307 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCEQ9HB96 536 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RARRES3Q9UL19 164 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SERTM1A2A2V5 107 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM107AO95990 144 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK1P06870 262 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 HSD3B1P14060 373 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ALAS2P22557 587 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 HSD3B2P26439 372 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 OLR1P78380 273 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CUL3Q13618 768 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0040Q15053 153 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD17CQ6PCB6 329 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 COMMD6Q7Z4G1 85 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 PDSS2Q86YH6 399 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR135Q8IZ08 494 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2L5Q8NG80 312 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CHTF18Q8WVB6 975 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 RTKNQ9BST9 563 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf109Q9NX04 203 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms