RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	AVPR1B	P47901	424 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCL11	P51671	97 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFNA3	P52797	238 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOC2A	Q14183	400 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SETDB1	Q15047	1291 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDK4	Q16654	411 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PFKFB4	Q16877	469 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLC3	Q6P597	504 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSS2	Q9NR19	701 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		15	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC189	A1A4V9	331 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	C4orf51	C9J302	202 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325		H0YIG0	161 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325		K7EPI3	171 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOCS6	O14544	535 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01	1e-6	■■■□□ 15.3
PRKCZ-222	ENST00000496325	RDH16	O75452	317 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	JRK	O75564	520 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLHL18	O94889	574 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	COL6A2	P12110	1019 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	GFAP	P14136	432 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP11	P24347	488 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	HNF4A	P41235	474 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	RGS1	Q08116	209 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHIT1	Q13231	466 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	XKR6	Q5GH73	641 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGSN	Q5TDP6	509 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATCAY	Q86WG3	371 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MZB1	Q8WU39	189 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR34	Q96EX3	536 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCYL1	Q96KG9	808 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRB3	Q9BUF7	120 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NT5DC2	Q9H857	520 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPG2	Q9UBF2	871 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	XPR1	Q9UBH6	696 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	OPTC	Q9UBM4	332 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	FETUB	Q9UGM5	382 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBK1	Q9UHD2	729 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ESPL1	Q14674	2120 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325		A6NL46	340 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGPS	O00116	658 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PEX12	O00623	359 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALOX12B	O75342	701 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	WFS1	O76024	890 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDGFA	P04085	211 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SBK3	P0C264	359 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	CXCR2	P25025	360 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB8A	P61006	207 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	IRF8	Q02556	426 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED25	Q71SY5	747 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT78	Q8N1N4	520 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX9	Q8N6V9	391 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRPV3	Q8NET8	790 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	MTBP	Q96DY7	904 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMIM10	Q96HG1	83 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PRKCZ-222	ENST00000496325	IP6K3	Q96PC2	410 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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