RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 FRG2BQ96QU4 278 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NEURL2Q9BR09 285 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BDH2Q9BUT1 245 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLMPQ9H6B4 373 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PPT2Q9UMR5 302 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 E7EQ34 232 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 H0YJX3 145 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 K7ESM1 405 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GUCY1B2O75343 617 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TULP3O75386 442 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RASAL1O95294 804 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A8O95907 504 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FUCA1P04066 466 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL6P05231 212 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CD59P13987 128 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GGT1P19440 569 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CD22P20273 847 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A11P48066 632 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NR1H2P55055 460 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PFN3P60673 137 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ST8SIA6P61647 398 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 APOFQ13790 326 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LIPIQ6XZB0 460 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CCDC138Q96M89 665 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MUC13Q9H3R2 512 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRRT4C9JH25 899 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GFYI3L273 518 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CXCR6O00574 342 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AXIN1O15169 862 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NOBOXO60393 691 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NPPAP01160 153 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FTH1P02794 183 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UMPSP11172 480 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDH1P12830 882 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF30P17039 623 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRKACGP22612 351 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A12P48065 614 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NUP107P57740 925 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DOC2AQ14183 400 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 STARD3Q14849 445 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DOK6Q6PKX4 331 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GPR180Q86V85 440 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ESX1Q8N693 406 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GLYATL1Q969I3 302 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR2AG1Q9H205 316 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NTN4Q9HB63 628 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 METTL12A8MUP2 240 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PSMD11O00231 422 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RFXANKO14593 260 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 B4GAT1O43505 415 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CST1P01037 141 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ALBP02768 609 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GBAP04062 536 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADH5P11766 374 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HNMTP50135 292 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CASP9P55211 416 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLDN8P56748 225 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ITGADQ13349 1161 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LAPTM4AQ15012 233 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 INAVAQ3KP66 663 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPESP1Q6UW49 350 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.74□□□□□ -1.33
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