RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-208ENST00000490163 NGBQ9NPG2 151 aa2.75□□□□□ -1.97
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UBXN4-208ENST00000490163 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa2.75□□□□□ -1.97
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UBXN4-208ENST00000490163 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.75□□□□□ -1.97
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UBXN4-208ENST00000490163 FOXJ3Q9UPW0 622 aa2.75□□□□□ -1.97
UBXN4-208ENST00000490163 BCL9LQ86UU0 1499 aa2.75□□□□□ -1.97
UBXN4-208ENST00000490163 H3BQF6 201 aa2.74□□□□□ -1.97
UBXN4-208ENST00000490163 J3KR12 359 aa2.74□□□□□ -1.97
UBXN4-208ENST00000490163 CLIC1O00299 241 aa2.74□□□□□ -1.97
UBXN4-208ENST00000490163 MAPK13O15264 365 aa2.74□□□□□ -1.97
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