RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 DCAF10Q5QP82 559 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 EID3Q8N140 333 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 PELI3Q8N2H9 469 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 RNF148Q8N7C7 305 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 LRTM2Q8N967 370 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 RNF149Q8NC42 400 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ELP5Q8TE02 316 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 PIK3R3Q92569 461 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ESAMQ96AP7 390 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 SCRN2Q96FV2 425 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 NSL1Q96IY1 281 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 BTBD9Q96Q07 612 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 SIRPDQ9H106 197 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CPVLQ9H3G5 476 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 EXOC1Q9NV70 894 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 IL36AQ9UHA7 158 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 NARFQ9UHQ1 456 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 KIF3AQ9Y496 699 aa4.1□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TULP2O00295 520 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CHUKO15111 745 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 AK1P00568 194 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CHRNGP07510 517 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 MSH3P20585 1137 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 LHCGRP22888 699 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ALDH4A1P30038 563 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 GAS1P54826 345 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 GIT2Q14161 759 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 KRT31Q15323 416 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 STX1AQ16623 288 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ARSKQ6UWY0 536 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF606Q8WXB4 792 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 C4orf45Q96LM5 186 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TXN2Q99757 166 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 VPS33BQ9H267 617 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 MALT1Q9UDY8 824 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 R4GN57 208 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.09□□□□□ -1.75
VPS13A-211ENST00000484581 A0A1W2PS18 150 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 HMMRO75330 724 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 KRT33AO76009 404 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ATP1B1P05026 303 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TPBGLP0DKB5 382 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ANPEPP15144 967 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 FUT1P19526 365 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ALDH1B1P30837 517 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 MAGEA11P43364 429 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 THBS3P49746 956 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 KCNK10P57789 538 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ELP6Q0PNE2 266 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 KDELC1Q6UW63 502 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.08□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms