RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 OR4F6Q8NGB9 312 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-208ENST00000476342 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF382Q96SR6 550 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-208ENST00000476342 ACSS2Q9NR19 701 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-208ENST00000476342 IL17BQ9UHF5 180 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-208ENST00000476342 USP24Q9UPU5 2620 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 H0YIG0 161 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM13O60858 407 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ALBP02768 609 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 CAPN1P07384 714 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ALOX12P18054 663 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 PTPN4P29074 926 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 HYAL2Q12891 473 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 DSG2Q14126 1118 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 VN1R5Q7Z5H4 357 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 OR9A4Q8NGU2 314 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 STARD8Q92502 1023 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 GSTO2Q9H4Y5 243 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 KCNK9Q9NPC2 374 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SLC22A11Q9NSA0 550 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SCN3AQ9NY46 2000 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 UQCRHLA0A096LP55 91 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 AGPSO00116 658 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 UQCRHP07919 91 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 PIK3CBP42338 1070 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ADNP2Q6IQ32 1131 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 OVCH1Q7RTY7 1134 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 GAL3ST3Q96A11 431 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ACTL8Q9H568 366 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TRPS1Q9UHF7 1281 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 LRIT2A6NDA9 550 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 PPP6CO00743 305 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 EFSO43281 561 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZWINTO95229 277 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ETV4P43268 484 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MC1RQ01726 317 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ADPRMQ3LIE5 342 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 FRMD7Q6ZUT3 714 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 COX15Q7KZN9 410 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 PRSS41Q7RTY9 318 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 HUS1BQ8NHY5 278 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SLC26A1Q9H2B4 701 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 H3BQF6 201 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 KLHL18O94889 574 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ALDH3A1P30838 453 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 PKNOX1P55347 436 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 OCA2Q04671 838 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TGM3Q08188 693 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 AGBL2Q5U5Z8 902 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 LETMD1Q6P1Q0 360 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 WDR20Q8TBZ3 569 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TLCD1Q96CP7 247 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MS4A6EQ96DS6 147 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 CMTM7Q96FZ5 175 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MS4A8Q9BY19 250 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 KLHL31Q9H511 634 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 WDR54Q9H977 334 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TCFL5Q9UL49 500 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZZEF1O43149 2961 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 A0A088AWK7 358 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 RAB8AP61006 207 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 VAC14Q08AM6 782 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 IFT88Q13099 833 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 DEFB134Q4QY38 66 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 FRG2Q64ET8 278 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM40Q6P9F5 258 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 CHSY3Q70JA7 882 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SYVN1Q86TM6 617 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 OR2L5Q8NG80 312 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 FAR2Q96K12 515 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 FRG2BQ96QU4 278 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 CENPKQ9BS16 269 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB3-208ENST00000476342 MECRQ9BV79 373 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms