RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 IPPKQ9H8X2 491 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SGK494L7N484 410 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 BMP10O95393 424 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM87AP0C7U9 286 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TAC1P20366 129 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CCT5P48643 541 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EMP2P54851 167 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXL2P58012 376 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CRB3Q9BUF7 120 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ING2Q9H160 280 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL31Q9H511 634 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf18Q9UK00 162 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CHD6Q8TD26 2715 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ARGFXA6NJG6 315 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MT66 165 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 AGPSO00116 658 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GLRA3O75311 464 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CRHR1P34998 444 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC18A2Q05940 514 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNAB2Q13303 367 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1A4Q13733 1029 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LY6DQ14210 128 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SYT16Q17RD7 645 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB134Q4QY38 66 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR7G3Q8NG95 312 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1F2PQ96R84 312 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NTMT1Q9BV86 223 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 AICDAQ9GZX7 198 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTR8Q9H981 624 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSS2Q9NR19 701 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PCTPQ9UKL6 214 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CACNA1GO43497 2377 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PQ72 361 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TLDC2A0PJX2 215 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM23A6NLE4 172 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IDSB3KWA1 339 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 H0YIV9 168 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SOCS6O14544 535 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RDH16O75452 317 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PIK3CBP42338 1070 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SOX8P57073 446 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB8AP61006 207 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RBBP7Q16576 425 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF10Q5QP82 559 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2L5Q8NG80 312 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCT6BQ92526 530 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 REPS1Q96D71 796 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A088AWK7 358 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR7A17O14581 309 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FFAR3O14843 346 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR42O15529 346 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST10O43529 356 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms