RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR137Q96N19 417 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 QRFPRQ96P65 431 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNC2Q96PR1 638 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB9Q9NP78 766 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD18Q9NS91 495 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RDH8Q9NYR8 311 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR34Q9UPC5 381 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CMAHPQ9Y471 501 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCA1A8K7I4 914 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SCELO95171 688 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 G6PDP11413 515 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP2K3P46734 347 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1G1P47890 313 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKGP49619 791 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GSK3AP49840 483 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN5P51795 746 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGDIBP52566 201 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA5P54756 1037 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-21P61565 698 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42EP1Q00587 391 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RUNX1T1Q06455 604 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NPRL3Q12980 569 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LCP2Q13094 533 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RPA4Q13156 261 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF273Q14593 569 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 EFHBQ8N7U6 833 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF149Q8NC42 400 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T29Q8NH02 315 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ESAMQ96AP7 390 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PYURFQ96I23 114 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TEKT5Q96M29 485 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00052Q96N35 136 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 COL21A1Q96P44 957 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SPASTQ9UBP0 616 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R129 80 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MASP2O00187 686 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HCRTO43612 131 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS26AO75436 327 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RAF1P04049 648 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MTHFD2P13995 350 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSBP15848 533 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ADH7P40394 386 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DIO1P49895 249 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1D1P51857 326 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ACLYP53396 1101 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TPI1P60174 286 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ST3GAL4Q11206 333 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH18Q13634 790 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNC3Q14003 757 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPT1Q15389 498 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB6Q15916 424 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL12Q53G59 568 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX20Q7Z614 316 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8K5Q8NH50 307 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 UPRTQ96BW1 309 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MGLLQ99685 303 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CD274Q9NZQ7 290 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM30A4D0T7 59 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QYT0 321 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 WWP2O00308 870 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH17O14917 1159 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A6P06703 90 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RRASP10301 218 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CD1DP15813 335 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GDI1P31150 447 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCR3P49682 368 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCNKAP51800 687 aa8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms