RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 PRMT3O60678 531 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SCN2BO60939 215 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ATG13O75143 517 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 FGBP02675 491 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP17A1P05093 508 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 FUT4P22083 530 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CD40LGP29965 261 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 WNT3P56703 355 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 AHSA2Q719I0 299 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT10Q86SR1 603 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SYT12Q8IV01 421 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CPA6Q8N4T0 437 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ITPAQ9BY32 194 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS29Q9UBQ0 182 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 QSOX1O00391 747 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGA12O60330 932 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC16A8O95907 504 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 LCKP06239 509 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBA1BP68363 451 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBA1AQ71U36 451 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 LACC1Q8IV20 430 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 APH1BQ8WW43 257 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC38A4Q969I6 547 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35B4Q969S0 331 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DACH2Q96NX9 599 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PKP4Q99569 1192 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 GULP1Q9UBP9 304 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ETHE1O95571 254 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 C9P02748 559 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 IMPA1P29218 277 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DGKGP49619 791 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CAMK1Q14012 370 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 VEZF1Q14119 521 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 MCFD2Q8NI22 146 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SPINT1O43278 529 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 UGT2B10P36537 528 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 HPS1Q92902 700 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 UBE2FQ969M7 185 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 EPYCQ99645 322 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 YY2O15391 372 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 OR8J2Q8NGG1 315 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ATL1Q8WXF7 558 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD9AQ99638 391 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DCSTAMPQ9H295 470 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP27Q9H306 513 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ISPDA4D126 451 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 H0YIV9 168 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3BGRLO75368 114 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CATP04040 527 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF33BQ06732 778 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC20Q12834 499 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ERAP2Q6P179 960 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 RTL10Q7L3V2 364 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 OR56A3Q8NH54 315 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SP140LQ9H930 580 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 SOD1P00441 154 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 ADH5P11766 374 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TGFBR1P36897 503 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms