RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MCCC2Q9HCC0 563 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT4BQ9UQ53 548 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 BACE2Q9Y5Z0 518 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD6O75354 484 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF432O94892 652 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 HSD3B1P14060 373 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 HSD3B2P26439 372 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ARFRP1Q13795 201 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ANO7Q6IWH7 933 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 SERTAD3Q9UJW9 196 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MYO9BQ13459 2157 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 LATS1O95835 1130 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 PEPDP12955 493 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ARSFP54793 590 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 GRM2Q14416 872 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MINDY2Q8NBR6 621 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K17Q8NGC6 315 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF304Q9HCX3 659 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 PLAGL1Q9UM63 463 aa19.59■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF208O43345 1280 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 STC2O76061 302 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 AHSA1O95433 338 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 STK19P49842 368 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 TUBA3CQ13748 450 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MPP2Q14168 576 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 TRAM2Q15035 370 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 COLEC12Q5KU26 742 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ATG9BQ674R7 924 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf40Q86WS4 652 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MOAP1Q96BY2 351 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 AASSQ9UDR5 926 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 OARD1Q9Y530 152 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC37A3O60309 1634 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 OR14I1A6ND48 311 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 CH25HO95992 272 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35E2BP0CK96 405 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 HRH2P25021 359 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 HYAL2Q12891 473 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 FAM189A2Q15884 450 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 FAM214AQ32MH5 1076 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 CITED4Q96RK1 184 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R9Q9NYW1 312 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.58■□□□□ 0.73
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD9O00233 223 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 EDNRAP25101 427 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 NIPAL1Q6NVV3 410 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PDSS2Q86YH6 399 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K14Q8NGD5 310 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SGIP1Q9BQI5 828 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PRKACGP22612 351 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R3AQ16821 1122 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 LMX1AQ8TE12 382 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 OR2M4Q96R27 311 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 CREBZFQ9NS37 354 aa19.58■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 FESP07332 822 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PSKH1P11801 424 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 GRIK2Q13002 908 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PTGR1Q14914 329 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TREML1Q86YW5 311 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A11Q9BYW1 496 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TOR3AQ9H497 397 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 KAT7O95251 611 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PLGP00747 810 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TYRP1P17643 537 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TPTEP56180 551 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 BNIP3Q12983 259 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PHF19Q5T6S3 580 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TUBA3EQ6PEY2 450 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 HSDL2Q6YN16 418 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC54Q8NEL0 328 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD11Q96NU1 681 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 BRD7Q9NPI1 651 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 OAZ2O95190 189 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 ACRV1P26436 265 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 RPS21P63220 83 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SUN3Q8TAQ9 357 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 RAB8BQ92930 207 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 SLC45A3Q96JT2 553 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 HRASLS2Q9NWW9 162 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 KLRF1Q9NZS2 232 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRC2P22695 453 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 ECHS1P30084 290 aa19.57■□□□□ 0.72
CCSAP-203ENST00000366687 TSTQ16762 297 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms