RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 UPP1Q16831 310 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 PKDCCQ504Y2 493 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 LIN54Q6MZP7 749 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 NETO1Q8TDF5 533 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 RFT1Q96AA3 541 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 CHIAQ9BZP6 476 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TRIM23P36406 574 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 DPP6P42658 865 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 PNLIPRP1P54315 467 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 NXPE1Q8N323 547 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 AP1G1O43747 822 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 NR4A2P43354 598 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 OMPP47874 163 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 COTL1Q14019 142 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 WDR48Q8TAF3 677 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 PIGKQ92643 395 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TREX1Q9NSU2 369 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 A0A0U1RQS6 177 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 PI15O43692 258 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 GPR32O75388 356 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 CRHBPP24387 322 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TAS2R50P59544 299 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 NFATC2Q13469 925 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 SPCS2Q15005 226 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 KDELC1Q6UW63 502 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 CHST9Q7L1S5 443 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 RNF130Q86XS8 419 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 TMED9Q9BVK6 235 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 GPR83Q9NYM4 423 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 IRAK3Q9Y616 596 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-202ENST00000353284 HCN1O60741 890 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 MAPK9P45984 424 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 SPIN4Q56A73 249 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 LRRC66Q68CR7 880 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 RAB8BQ92930 207 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 OR10H2O60403 315 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 OR7A10O76100 309 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 IFNGP01579 166 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 SHMT2P34897 504 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 GMFBP60983 142 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 TXNDC8Q6A555 127 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 DLGAP1O14490 977 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-202ENST00000353284 RYKP34925 604 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms