RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MAOBP27338 520 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ETV5P41161 510 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ACTR1BP42025 376 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KRT6CP48668 564 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HTR6P50406 440 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ACTR1AP61163 376 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RAC1P63000 192 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TAP2Q03519 686 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PCDH1Q08174 1060 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KRT33BQ14525 404 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CCDC6Q16204 474 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TMEM198Q66K66 360 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LIN54Q6MZP7 749 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CHSY3Q70JA7 882 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 IQCHQ86VS3 1027 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PARGQ86W56 976 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 OR2T11Q8NH01 316 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PHF12Q96QT6 1004 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 BAG5Q9UL15 447 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.83□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TAF4O00268 1085 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP33O14559 1287 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DCXO43602 365 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 UGDHO60701 494 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF4O60810 478 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 T-ENOLP0DO92 83 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NPPBP16860 134 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CCND1P24385 295 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 FNTBP49356 437 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HPCAP84074 193 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CHIT1Q13231 466 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 MADCAM1Q13477 382 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 XKR6Q5GH73 641 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LIPJQ5W064 366 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NRTNQ99748 197 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZFP57Q9NU63 452 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A1Q9NY26 324 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 M0R296 226 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 UBDO15205 165 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CBX6O95503 412 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 JUPP14923 745 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PKLRP30613 574 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SCTRP47872 440 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 IRF8Q02556 426 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DOC2AQ14183 400 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 MAPRE2Q15555 327 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LCTLQ6UWM7 567 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LAYNQ6UX15 382 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TTLQ8NG68 377 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 USP7Q93009 1102 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NEIL2Q969S2 332 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NSL1Q96IY1 281 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 MIPEPQ99797 713 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms