RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MLIPQ5VWP3 458 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP10Q96AY3 582 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TLCD1Q96CP7 247 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PPP6CO00743 305 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ALOX12P18054 663 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ITGAXP20702 1163 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN4P29074 926 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FAM198BQ6UWH4 519 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CHSY3Q70JA7 882 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 VN1R5Q7Z5H4 357 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CMTM7Q96FZ5 175 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CNDP1Q96KN2 507 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ACSS2Q9NR19 701 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A11Q9NSA0 550 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TRPS1Q9UHF7 1281 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PADI2Q9Y2J8 665 aa25.41■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 RECKO95980 971 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM10L1P0DMW3 83 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FBLP22087 321 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 F8A1P23610 371 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TMPRSS3P57727 454 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MC1RQ01726 317 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TGM3Q08188 693 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 DSG2Q14126 1118 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 NCF4Q15080 339 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OR9A4Q8NGU2 314 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 WDR20Q8TBZ3 569 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GAL3ST3Q96A11 431 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM10Q96HG1 83 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL31Q9H511 634 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 IL17BQ9UHF5 180 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SNX6Q9UNH7 406 aa25.4■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 EFSO43281 561 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OR4F21O95013 312 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 BPGMP07738 259 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 IL1RNP18510 177 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC18A1P54219 525 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OCA2Q04671 838 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 IFT88Q13099 833 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC9A5Q14940 896 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM35AQ53FP2 167 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FRG2Q64ET8 278 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FAR2Q96K12 515 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FRG2BQ96QU4 278 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TRMOQ9BU70 441 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF225Q9UK10 706 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.39■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 A0A088AWK7 358 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 BIRC5O15392 142 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL18O94889 574 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ESRRBO95718 433 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ADNP2Q6IQ32 1131 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 SYVN1Q86TM6 617 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 NUDCD3Q8IVD9 361 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 HOMEZQ8IX15 550 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 OR2L5Q8NG80 312 aa25.38■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms