RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 INTUQ9ULD6 942 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLCQ9ULV8 474 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DNHD1Q96M86 4753 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51F1A6NGY5 319 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCF5A8MTL0 148 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 E5RI56 91 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 E7EVH7 732 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 H7C1Q1 480 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SGK494L7N484 410 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 AP3B1O00203 1094 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP7O14520 342 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NRP2O60462 931 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MAN1A2O60476 641 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HCN1O60741 890 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA10O75578 1167 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IL2RAP01589 272 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHG3P01860 377 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ERGP11308 486 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FPR1P21462 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TACR1P25103 407 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 UBASH3AP57075 661 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SORDQ00796 357 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RHAGQ02094 409 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A1Q14973 349 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS9Q3SYG4 887 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC38Q502W7 563 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC4Q5J8M3 183 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPGQ86U10 573 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT222Q8N1A0 295 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LIX1Q8N485 282 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTL9Q8TC94 416 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 VMP1Q96GC9 406 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP5K1AQ99755 562 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NFS1Q9Y697 457 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RTTNQ86VV8 2226 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVC2 190 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCA1A8K7I4 914 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM166BA8MTA8 275 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 INAFM1C9JVW0 142 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 H7BY64 318 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1CO00159 1063 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HAT1O14929 419 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB14O43829 449 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RDH16O75452 317 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFAND5O76080 213 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MATN4O95460 622 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 P04436 131 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP5P22003 454 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CCND1P24385 295 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS1Q08116 209 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM14Q14142 442 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TERF2Q15554 542 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TRILQ7L0X0 811 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD13Q7L211 337 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2M7Q8NG81 312 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPDL3BQ92485 455 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT35Q92764 455 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ISL2Q96A47 359 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms