RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CD40LGP29965 261 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 GJA8P48165 433 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 GPR65Q8IYL9 337 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 MCFD2Q8NI22 146 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 FAM8A1Q9UBU6 413 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TESMINQ9Y4I5 508 aa26.92■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 FADS2P1A8MWK0 482 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0355O15063 1070 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PCDH7O60245 1069 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A8O95907 504 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 FCHO2Q0JRZ9 810 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 IFI44LQ53G44 452 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 MED27Q6P2C8 311 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 OR10G2Q8NGC3 310 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 BTN2A2Q8WVV5 523 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 FOPNLQ96NB1 174 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 VPS35Q96QK1 796 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 WBP1LQ9NX94 342 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 KCNE2Q9Y6J6 123 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SLC5A10A0PJK1 596 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CLCA1A8K7I4 914 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 AIREO43918 545 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 LILRB3O75022 631 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CDK1P06493 297 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ETV3P41162 512 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TUBA3EQ6PEY2 450 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 OR4C15Q8NGM1 316 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 DACH2Q96NX9 599 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PKP4Q99569 1192 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 HEPHQ9BQS7 1158 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 REEP4Q9H6H4 257 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 THSD1Q9NS62 852 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SPASTQ9UBP0 616 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 A3GALT2U3KPV4 340 aa26.91■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF21O75509 655 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 VIPP01282 170 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ITGA2P17301 1181 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PPM1AP35813 382 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 LIPAP38571 399 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CRATP43155 626 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PRLHRP49683 370 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 MVDP53602 400 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 DMC1Q14565 340 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ZNF284Q2VY69 593 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CCSMST1Q4G0I0 132 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ADNP2Q6IQ32 1131 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TMEM25Q86YD3 366 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 LACC1Q8IV20 430 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 DEPDC4Q8N2C3 294 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 GPR156Q8NFN8 814 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CCM2Q9BSQ5 444 aa26.9■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN11A1L157 253 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 NPC1O15118 1278 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 CTSKP43235 329 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 BDKRB1P46663 353 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 RPS13P62277 151 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ZNF763Q0D2J5 394 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ZNF404Q494X3 552 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 GCNT6Q5T4J0 391 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 SLC5A8Q8N695 610 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 OR52N2Q8NGI0 321 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 PTPRSQ13332 1948 aa26.89■■□□□ 1.9
UBP1-201ENST00000283628 TGM5O43548 720 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 HLA-EP13747 358 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GJA1P17302 382 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 RPL3P39023 403 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PREPP48147 710 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TIGD6Q17RP2 521 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FBXO43Q4G163 708 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 USP43Q70EL4 1123 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CCDC80Q76M96 950 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SNX29P2Q8IUI4 249 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 DENND6BQ8NEG7 585 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 YME1L1Q96TA2 773 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TMEM38AQ9H6F2 299 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.89■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ISPDA4D126 451 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZBBXA8MT70 800 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 M0R082 166 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF197O14709 1029 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ACRP10323 421 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SYT16Q17RD7 645 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 MICAQ29983 383 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 RAD9AQ99638 391 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 INIPQ9NRY2 104 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms