RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 ELOVL2Q9NXB9 296 aa17.01■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEB3O15480 346 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 UBXN7O94888 489 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MORN1Q5T089 497 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A4Q9H015 551 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ARNT2Q9HBZ2 717 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MKLN1Q9UL63 735 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 BPIP17213 487 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PGDP52209 483 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 VBP1P61758 197 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ABHD13Q7L211 337 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MARCH9Q86YJ5 346 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 WASH4PA8MWX3 477 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RCBTB2O95199 551 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GIMD1P0DJR0 217 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TCEANCQ8N8B7 351 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CNIH3Q8TBE1 160 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IL17CQ9P0M4 197 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RHCGQ9UBD6 479 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 H7BY64 318 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 STATHP02808 62 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CYBAP13498 195 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC8B1Q6J4K2 584 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C17orf99Q6UX52 265 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 METTL21AQ8WXB1 218 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 NCSTNQ92542 709 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RNF31Q96EP0 1072 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRAP1Q96NZ9 151 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TREX1Q9NSU2 369 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PLAGL1Q9UM63 463 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa17■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FAM172BPA6NC97 362 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SERPINA3P01011 423 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IFNA6P05013 189 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 INHBCP55103 352 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ADAM17P78536 824 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PON2Q15165 354 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GNB5O14775 395 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 HLA-DPB1P04440 258 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 UQCRC2P22695 453 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CDH11P55287 796 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GMFGO60234 142 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FUT4P22083 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 STARP49675 285 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 LSAMPQ13449 338 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 APCDD1Q8J025 514 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 NRG4Q8WWG1 115 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.99■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 A6NHS1 94 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1G1O75348 118 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CD2P06729 351 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MATN1P21941 496 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ACVR2AP27037 513 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ST3GAL4Q11206 333 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RAB41Q5JT25 222 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SCRN2Q96FV2 425 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 BOCQ9BWV1 1114 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TCF7L1Q9HCS4 588 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GGT1P19440 569 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ABATP80404 500 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 POF1BQ8WVV4 589 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FAM129BQ96TA1 746 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 EHD1Q9H4M9 534 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 USP3Q9Y6I4 520 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CH25HO95992 272 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms