RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RIT1Q92963 219 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 COQ8BQ96D53 544 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CDCA5Q96FF9 252 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CD84Q9UIB8 345 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 B8ZZF3 427 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 STBD1O95210 358 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CDK1P06493 297 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CD52P31358 61 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CRISP1P54107 249 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 DUSP4Q13115 394 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 DAPL1A0PJW8 107 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 BCHEP06276 602 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FCER2P06734 321 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 ZXDBP98169 803 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 BTN1A1Q13410 526 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SNTA1Q13424 505 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TUSC3Q13454 348 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NTRK2Q16620 822 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CPZQ66K79 652 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MTSS1LQ765P7 747 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FTMTQ8N4E7 242 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NELL2Q99435 816 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 H7C4K7 107 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TGFB1P01137 390 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FGBP02675 491 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MAGEA12P43365 314 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MAN2A2P49641 1150 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CDH11P55287 796 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 AP3S2P59780 193 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SCAPQ12770 1279 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 GALEQ14376 348 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MED27Q6P2C8 311 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NUDT8Q8WV74 236 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 ISL2Q96A47 359 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 ARMC5Q96C12 935 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RNF181Q9P0P0 153 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 NUP98P52948 1817 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 COL1A2P08123 1366 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 OR14I1A6ND48 311 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MSL3P1P0C860 447 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 AVPR1BP47901 424 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 MLLT10P55197 1068 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 GHRHRQ02643 423 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SLC3A1Q07837 685 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 GINS1Q14691 196 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 DNASE1L2Q92874 299 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 RFPL3O75679 317 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 PDYNP01213 254 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SSTR2P30874 369 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 DSTNP60981 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.56□□□□□ -0.08
CASC3-201ENST00000264645 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms