RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W RTT10Q08924 1013 aa5.2□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W BAS1P22035 811 aa5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W ASF1P32447 279 aa5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W CHS7P38843 316 aa5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W PHO23P50947 330 aa5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.19□□□□□ -1.58not detected
NSE4YDL105W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W GNT1Q12096 491 aa5.19□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W PEP7P32609 515 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RER2P35196 286 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W MCM7P38132 845 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W FYV10P40492 516 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RMD1Q03441 430 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W HMI1Q12039 706 aa5.18□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W THS1P04801 734 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W EMC1P25574 760 aa5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W GEM1P39722 662 aa5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RRT14P40470 206 aa5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W MSC2Q03455 724 aa5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W ACM1Q08981 209 aa5.16□□□□□ -1.58
NSE4YDL105W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W UGA2P38067 497 aa5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W MXR1P40029 184 aa5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W IOC3P43596 787 aa5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W YML122CQ03207 126 aa5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W ACE2P21192 770 aa5.14□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W MSS4P38994 779 aa5.14□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W KIN4Q01919 800 aa5.14□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W GCV2P49095 1034 aa5.13□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W BI4P03879 638 aa5.12□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W LYP1P32487 611 aa5.12□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W SLA2P33338 968 aa5.12□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W PLB1P39105 664 aa5.12□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W PNT1P38969 423 aa5.11□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W TRP2P00899 507 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W DBP2P24783 546 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W PET112P33893 541 aa5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W SIP5P40210 489 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W MND2P40577 368 aa5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W RKM4Q12504 494 aa5.1□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W CDC34P14682 295 aa5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W MET12P46151 657 aa5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W HFM1P51979 1187 aa5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W TPO1Q07824 586 aa5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W PPM2Q08282 695 aa5.09□□□□□ -1.59
NSE4YDL105W HIS5P07172 385 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W DUT1P33317 147 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W OAR1P35731 278 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W POA1P38218 177 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W SNF7P39929 240 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W TYW3P53177 273 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W SNU71P53207 620 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.08□□□□□ -1.6not detected
NSE4YDL105W AIM39Q08223 395 aa5.08□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W INO1P11986 533 aa5.07□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W MNR2P35724 969 aa5.07□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W MET10P39692 1035 aa5.07□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W ADY3Q07732 790 aa5.07□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W PFK1P16861 987 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W YKL107WP34251 309 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W ZRG8P40021 1076 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W EXG2P52911 562 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W EEB1Q02891 456 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W SPO20Q04359 397 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W OSW2Q12202 724 aa5.06□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W ENA1P13587 1091 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W MOT2P34909 587 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W MOH1P38191 138 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W CHA4P43634 648 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W YGL176CP46945 554 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W UBA2P52488 636 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W MTC3P53077 123 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W ENA2Q01896 1091 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W YLL058WQ12198 575 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W ENA5Q12691 1091 aa5.05□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W HRR25P29295 494 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W YAP1801P38856 637 aa5.04□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W YPL066WQ12194 479 aa5.04□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W XYL2Q07993 356 aa5.03□□□□□ -1.6
NSE4YDL105W KRI1P42846 591 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
NSE4YDL105W YGR012WP53206 393 aa5.01□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W MDM38Q08179 573 aa5.01□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W NAP1P25293 417 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W FUN30P31380 1131 aa5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W PSP2P50109 593 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W YGR053CP53234 283 aa5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W SVF1Q05515 481 aa5□□□□□ -1.61
NSE4YDL105W HRQ1Q05549 1077 aa5□□□□□ -1.61
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