RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 ALS2Q96Q42 1657 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 HSPA2P54652 639 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 SPG7Q9UQ90 795 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 ABCC6O95255 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 KSR2Q6VAB6 950 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CLN8-212ENST00000637083 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 PXDNQ92626 1479 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 SRGAP3O43295 1099 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TRAK2O60296 914 aa14.83□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 MCM2P49736 904 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ANAPC15P60006 121 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 NUCB2P80303 420 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 RILPL2Q969X0 211 aa14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 MTX1Q13505 466 aa14.81□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ADCY9O60503 1353 aa14.81□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CHMLP26374 656 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.8□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 LINS1Q8NG48 757 aa14.79□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 ZNF790Q6PG37 636 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 CNTROBQ8N137 903 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.78□□□□□ -0.04
CLN8-212ENST00000637083 PHKG2P15735 406 aa14.77□□□□□ -0.04
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CLN8-212ENST00000637083 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 IL17RAQ96F46 866 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 DCAF5Q96JK2 942 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 RGPD5Q99666 1765 aa14.76□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 UTYO14607 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 CPDO75976 1380 aa14.75□□□□□ -0.05
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CLN8-212ENST00000637083 CHRNA2Q15822 529 aa14.75□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 NEK4P51957 841 aa14.74□□□□□ -0.05
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CLN8-212ENST00000637083 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.74□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 COL18A1P39060 1754 aa14.73□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.73□□□□□ -0.05
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CLN8-212ENST00000637083 MRC1P22897 1456 aa14.72□□□□□ -0.05
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CLN8-212ENST00000637083 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 SSFA2P28290 1259 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.72□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 MRE11P49959 708 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 PDIA6Q15084 440 aa14.71□□□□□ -0.05
CLN8-212ENST00000637083 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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