RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL17REQ8NFR9 667 aa21.36■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.34■■□□□ 1.01
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.32■■□□□ 1
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.25■□□□□ 0.99
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TRAPPC3-210ENST00000617904 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC3-210ENST00000617904 C4BP0C0L5 1744 aa21.19■□□□□ 0.98
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TRAPPC3-210ENST00000617904 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.16■□□□□ 0.98
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC3-210ENST00000617904 CACNA1FO60840 1977 aa21.13■□□□□ 0.97
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITPK1Q13572 414 aa21.12■□□□□ 0.97
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