RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP6P35125 1406 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 PIK3C2AO00443 1686 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMF1P82094 1093 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 IFFO2Q5TF58 517 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP21Q9UK80 565 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 MTRQ99707 1265 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4DIP-240ENST00000613995 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 RGPD5Q99666 1765 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 MYOM1P52179 1685 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NLRP13Q86W25 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 IL21Q9HBE4 155 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 SSH2Q76I76 1423 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 A0A1W2PP64 1363 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 FAM83GA6ND36 823 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 RXRBP28702 533 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 KCNC4Q03721 635 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 FUT2Q10981 343 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CHRNA2Q15822 529 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDCA8Q53HL2 280 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 LTN1O94822 1766 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NRAPQ86VF7 1730 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 KIAA0232Q92628 1395 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 MS4A1P11836 297 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 COPS2P61201 443 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NME9Q86XW9 330 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BTG4Q9NY30 223 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLIT2O94813 1529 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP19O94966 1318 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 KDM4AO75164 1064 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 GCP02774 474 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ATP6V1AP38606 617 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF516Q92618 1163 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLIT3O75094 1523 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ATRNO75882 1429 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP54Q70EL1 1684 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZPR1O75312 459 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 USP46P62068 366 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 MORN1Q5T089 497 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 STRN4Q9NRL3 753 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 GLI3P10071 1580 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 SOCS7O14512 581 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 NR1I2O75469 434 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 EVA1CP58658 441 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 COL18A1P39060 1754 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4DIP-240ENST00000613995 RGS12O14924 1447 aa7.09□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 EP400Q96L91 3159 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 NFAT5O94916 1531 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 A0A0G2JS52 829 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 HOXA2O43364 376 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 VPS72Q15906 364 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4DIP-240ENST00000613995 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.08□□□□□ -1.28
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