RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 IRS1P35568 1242 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 CEP162Q5TB80 1403 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 TIAM1Q13009 1591 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 USP17L8P0C7I0 530 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 PTGIRP43119 386 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 AGLP35573 1532 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 ADAMTS2O95450 1211 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 GAS6Q14393 721 aa8.66□□□□□ -1.02
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HERC3-212ENST00000597259 CYLDQ9NQC7 956 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-212ENST00000597259 C3P01024 1663 aa8.65□□□□□ -1.03
HERC3-212ENST00000597259 PLXNC1O60486 1568 aa8.65□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HERC3-212ENST00000597259 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.64□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.64□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-212ENST00000597259 STRCQ7RTU9 1775 aa8.63□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-212ENST00000597259 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-212ENST00000597259 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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HERC3-212ENST00000597259 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.56□□□□□ -1.04
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HERC3-212ENST00000597259 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.54□□□□□ -1.04
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HERC3-212ENST00000597259 SCTRP47872 440 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ERVK-9P63128 1117 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 PTPRKQ15262 1439 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 GPC1P35052 558 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 FOXK2Q01167 660 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-212ENST00000597259 ACDQ96AP0 544 aa8.51□□□□□ -1.05
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