RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 KLHL34Q8N239 644 aa26.27■■□□□ 1.8
EFTUD2-217ENST00000590124 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.27■■□□□ 1.8
EFTUD2-217ENST00000590124 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
EFTUD2-217ENST00000590124 RIPK4P57078 832 aa26.26■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 RUNDC1Q96C34 613 aa26.26■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 COL15A1P39059 1388 aa26.25■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.25■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 MMP10P09238 476 aa26.24■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.24■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.24■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.22■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC184Q52MB2 194 aa26.22■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 USP16Q9Y5T5 823 aa26.22■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.2■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.2■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 FKBP8Q14318 412 aa26.2■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 NARFQ9UHQ1 456 aa26.2■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.2■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 A1BGP04217 495 aa26.19■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.19■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.19■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 ZPR1O75312 459 aa26.18■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 ANP32CO43423 234 aa26.17■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.17■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.17■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 TM4SF1P30408 202 aa26.16■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 NEUROD2Q15784 382 aa26.16■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 SCN7AQ01118 1682 aa26.15■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.15■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A087WZG4 1122 aa26.15■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 DDR1Q08345 913 aa26.15■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.14■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.14■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.14■■□□□ 1.78
EFTUD2-217ENST00000590124 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 BCORQ6W2J9 1755 aa26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF26B4DH59 902 aa26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 NBPF15Q8N660 670 aa26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.11■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 NFIXQ14938 502 aa26.1■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 GPR162Q16538 588 aa26.1■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.1■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 APAF1O14727 1248 aa26.09■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.09■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.09■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.772e-7■□□□□ 10.2
EFTUD2-217ENST00000590124 MRS2Q9HD23 443 aa26.08■■□□□ 1.77
EFTUD2-217ENST00000590124 CHL1O00533 1208 aa26.07■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 CAMTA2O94983 1202 aa26.07■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 TGFB2P61812 414 aa26.06■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 CHD4Q14839 1912 aa26.04■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.03■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
EFTUD2-217ENST00000590124 SERPINB2P05120 415 aa26.01■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 CFAP44Q96MT7 982 aa26.01■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 ERBB4Q15303 1308 aa26■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A0G2JLW4 131 aa26■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 YY1P25490 414 aa26■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 BICDL1Q6ZP65 573 aa26■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 RGL2O15211 777 aa25.99■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 GRIN3BO60391 1043 aa25.99■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF853P0CG23 659 aa25.99■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 DPEP1P16444 411 aa25.99■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.99■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 UTRNP46939 3433 aa25.98■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNA3P22001 575 aa25.98■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.97■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 KRT24Q2M2I5 525 aa25.97■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.97■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 PDIA6Q15084 440 aa25.96■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.96■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 MBIPQ9NS73 344 aa25.96■■□□□ 1.75
EFTUD2-217ENST00000590124 MYL6BP14649 208 aa25.95■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 IFT57Q9NWB7 429 aa25.95■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.94■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC27Q2M243 656 aa25.94■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 SETDB2Q96T68 719 aa25.94■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.94■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.93■■□□□ 1.74
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms