RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 HIC1Q14526 733 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.46□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 MTFR1LQ9H019 292 aa9.46□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PIK3C2GO75747 1445 aa9.46□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRR20EP86478 221 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRR20CP86479 221 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRR20DP86480 221 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRR20BP86481 221 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRR20AP86496 221 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PDE3BQ13370 1112 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 POGKQ9P215 609 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 DGAT1O75907 488 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 JMYQ8N9B5 988 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 KLRG1Q96E93 195 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 WDR90Q96KV7 1748 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 ABCA3Q99758 1704 aa9.44□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 TNS2Q63HR2 1409 aa9.43□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.43□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 MAP3K5Q99683 1374 aa9.43□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.43□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 TNFRSF10AO00220 468 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 GRIN3BO60391 1043 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PPLO60437 1756 aa9.42□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 FAM187AA6NFU0 413 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PRAM1Q96QH2 718 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 SPSB2Q99619 263 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 STK32BQ9NY57 414 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 USP35Q9P2H5 1018 aa9.41□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 GNPATO15228 680 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 GDF9O60383 454 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 RDH13Q8NBN7 331 aa9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
LAMA3-211ENST00000590104 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 SBNO1A3KN83 1393 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 ARHGEF10O15013 1369 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 SLC15A2Q16348 729 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.39□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 PLSCR1O15162 318 aa9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 FECHP22830 423 aa9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 STRN4Q9NRL3 753 aa9.38□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.37□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.37□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 ADCY9O60503 1353 aa9.37□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.37□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.36□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 SBF2Q86WG5 1849 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 TOMM70O94826 608 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 FUT2Q10981 343 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 FOXC1Q12948 553 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 MORN1Q5T089 497 aa9.35□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 ATP6V1AP38606 617 aa9.34□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 NLRP7Q8WX94 980 aa9.34□□□□□ -0.91
LAMA3-211ENST00000590104 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.34□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 KIF1AQ12756 1690 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 POTECB2RU33 542 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 GPR37O15354 613 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 SULF1Q8IWU6 871 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 IFT172Q9UG01 1749 aa9.33□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 ST8SIA5O15466 376 aa9.32□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 RPIAP49247 311 aa9.32□□□□□ -0.92
LAMA3-211ENST00000590104 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
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