RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 GRIN3BO60391 1043 aa26.78■■□□□ 1.88
GIPC1-211ENST00000589631 ZPR1O75312 459 aa26.77■■□□□ 1.88
GIPC1-211ENST00000589631 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
GIPC1-211ENST00000589631 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.77■■□□□ 1.88
GIPC1-211ENST00000589631 COL15A1P39059 1388 aa26.76■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 KCNQ3O43525 872 aa26.76■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 DCTN1Q14203 1278 aa26.76■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 FKBP8Q14318 412 aa26.76■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 NARFQ9UHQ1 456 aa26.76■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 TGFB2P61812 414 aa26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 NFE2L2Q16236 605 aa26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.74■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 TM4SF1P30408 202 aa26.73■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 UTRNP46939 3433 aa26.72■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.72■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.72■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 A0A087WZG4 1122 aa26.71■■□□□ 1.87
GIPC1-211ENST00000589631 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.7■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 DDR1Q08345 913 aa26.69■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.68■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.68■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 USP16Q9Y5T5 823 aa26.68■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 A1BGP04217 495 aa26.67■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 NFIXQ14938 502 aa26.65■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 A0A0G2JLW4 131 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-211ENST00000589631 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 DPEP1P16444 411 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 RIPK4P57078 832 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 SERPINB2P05120 415 aa26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 KCNA3P22001 575 aa26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 SCN7AQ01118 1682 aa26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.58■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 RUNDC1Q96C34 613 aa26.58■■□□□ 1.85
GIPC1-211ENST00000589631 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.57■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 CAMTA2O94983 1202 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 PIM2Q9P1W9 311 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 BCS1LQ9Y276 419 aa26.56■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 NBPF26B4DH59 902 aa26.55■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 NBPF15Q8N660 670 aa26.55■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 BCORQ6W2J9 1755 aa26.54■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.54■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.54■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.53■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.53■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 RGL2O15211 777 aa26.52■■□□□ 1.84
GIPC1-211ENST00000589631 CHRNA5P30532 468 aa26.51■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.51■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.5■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 SETDB2Q96T68 719 aa26.5■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 NEUROD2Q15784 382 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.49■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.48■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.47■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 ADCY9O60503 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.46■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.45■■□□□ 1.83
GIPC1-211ENST00000589631 ERBB4Q15303 1308 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 H0YIN7 160 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 CHL1O00533 1208 aa26.44■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 ATP10DQ9P241 1426 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 PDE6BP35913 854 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.43■■□□□ 1.82
GIPC1-211ENST00000589631 CNBD1Q8NA66 436 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms