RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 BCANQ96GW7 911 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 C2CD2LO14523 706 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 TIAM1Q13009 1591 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 RRAGCQ9HB90 399 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 PGBD3Q8N328 593 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 BNIP3LO60238 219 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 BMP4P12644 408 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 BAG6P46379 1132 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 CTBSQ01459 385 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 FGFR3P22607 806 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 EFHC2Q5JST6 749 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 GGA1Q9UJY5 639 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 APBB1O00213 710 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 GRIN2CQ14957 1233 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 TLR1Q15399 786 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 FURINP09958 794 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 AMPD1P23109 780 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 USP4Q13107 963 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 BTBD6Q96KE9 485 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 EPXP11678 715 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 PLA2G4AP47712 749 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CUL7Q14999 1698 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 ARAFP10398 606 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 ATP4AP20648 1035 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 SCNN1DP51172 638 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 IRF5Q13568 498 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 HCN2Q9UL51 889 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 GNB5O14775 395 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 RNF135Q8IUD6 432 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-212ENST00000580838 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 MAPKBP1O60336 1514 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 FMN1Q68DA7 1419 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 DGKGP49619 791 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 INHAP05111 366 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 GDF10P55107 478 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 CD163Q86VB7 1156 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 NLRP8Q86W28 1048 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 KLF15Q9UIH9 416 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 Q8N3U1 123 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 SIRT1Q96EB6 747 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-212ENST00000580838 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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