RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 KLRG1Q96E93 195 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 TJP1Q07157 1748 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 RPS6KA4O75676 772 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 RFC4P35249 363 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 NEFMP07197 916 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 SLC39A6Q13433 755 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 KCNA3P22001 575 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 FSTL1Q12841 308 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 JMYQ8N9B5 988 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 RNF181Q9P0P0 153 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 PIM2Q9P1W9 311 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 IL17REQ8NFR9 667 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 RALBP1Q15311 655 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS2-204ENST00000571386 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 CAPN15O75808 1086 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF790Q6PG37 636 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 DDR1Q08345 913 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 RRAGCQ9HB90 399 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 STARD3NLO95772 234 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 FKBP8Q14318 412 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 BTBD11A6QL63 1104 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 ZPR1O75312 459 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 CHRNA5P30532 468 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 TNS4Q8IZW8 715 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS2-204ENST00000571386 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 MCM10Q7L590 875 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 COL15A1P39059 1388 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 RASSF7Q02833 373 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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SPNS2-204ENST00000571386 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 PRELPP51888 382 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 DCTN1Q14203 1278 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS2-204ENST00000571386 A0A087WZG4 1122 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 NARFQ9UHQ1 456 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 NFE2L2Q16236 605 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 TM4SF1P30408 202 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 KCNQ3O43525 872 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 LMNB1P20700 586 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 GLTPD2A6NH11 291 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 A1BGP04217 495 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 NFIXQ14938 502 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 CACNA1SQ13698 1873 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 SCN7AQ01118 1682 aa21.86■■□□□ 1.09
SPNS2-204ENST00000571386 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.86■■□□□ 1.09
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