RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 PDE3AQ14432 1141 aa23.1■■□□□ 1.29
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SPNS2-202ENST00000570641 TJP1Q07157 1748 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-202ENST00000570641 FKBP8Q14318 412 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-202ENST00000570641 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-202ENST00000570641 USP16Q9Y5T5 823 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-202ENST00000570641 PTPRCP08575 1304 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS2-202ENST00000570641 ERBB4Q15303 1308 aa23.08■■□□□ 1.29
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SPNS2-202ENST00000570641 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.06■■□□□ 1.28
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SPNS2-202ENST00000570641 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS2-202ENST00000570641 STARD3NLO95772 234 aa23.05■■□□□ 1.28
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SPNS2-202ENST00000570641 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.04■■□□□ 1.28
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SPNS2-202ENST00000570641 G2E3Q7L622 706 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS2-202ENST00000570641 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.04■■□□□ 1.28
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SPNS2-202ENST00000570641 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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SPNS2-202ENST00000570641 PROSER3Q2NL68 480 aa23■■□□□ 1.27
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SPNS2-202ENST00000570641 CRBNQ96SW2 442 aa23■■□□□ 1.27
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SPNS2-202ENST00000570641 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.9■■□□□ 1.26
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SPNS2-202ENST00000570641 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS2-202ENST00000570641 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS2-202ENST00000570641 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS2-202ENST00000570641 APBA3O96018 575 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS2-202ENST00000570641 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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