RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 SIK1P57059 783 aa19.84■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.84■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.84■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 USP16Q9Y5T5 823 aa19.84■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 BCAR3O75815 825 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 NECTIN2Q92692 538 aa19.83■□□□□ 0.77
CTU2-209ENST00000567316 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 ATP6V1AP38606 617 aa19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.81■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 C4BP0C0L5 1744 aa19.8■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.8■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 NUP98P52948 1817 aa19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 ITPK1Q13572 414 aa19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.79■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 STK31Q9BXU1 1019 aa19.78■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.78■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 LRP5O75197 1615 aa19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 STARD3NLO95772 234 aa19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 SLC4A2P04920 1241 aa19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 PDIA6Q15084 440 aa19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CTU2-209ENST00000567316 ERBB4Q15303 1308 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 A1BGP04217 495 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 KCNQ4P56696 695 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 SLC15A2Q16348 729 aa19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 CASZ1Q86V15 1759 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 ANXA1P04083 346 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 PROSER3Q2NL68 480 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 G2E3Q7L622 706 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 STK32BQ9NY57 414 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.75■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 C4AP0C0L4 1744 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 NBPF26B4DH59 902 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 NBPF15Q8N660 670 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 AKT1S1Q96B36 256 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 BCORQ6W2J9 1755 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa19.74■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.73■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 KIF16BQ96L93 1317 aa19.73■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 PLIN1O60240 522 aa19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 MYL6BP14649 208 aa19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 HYPKQ9NX55 129 aa19.72■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.71■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.71■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.71■□□□□ 0.75
CTU2-209ENST00000567316 FLIIQ13045 1269 aa19.7■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 ZNF827Q17R98 1081 aa19.69■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.69■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.69■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 PTPRCP08575 1304 aa19.69■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.68■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 TNNQ9UQP3 1299 aa19.68■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 COPS6Q7L5N1 327 aa19.67■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.67■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 SCN7AQ01118 1682 aa19.67■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 TRIM27P14373 513 aa19.66■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.65■□□□□ 0.74
CTU2-209ENST00000567316 RPS6KA4O75676 772 aa19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms