RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	SIK1	P57059	783 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	BTAF1	O14981	1849 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.7	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	ANXA1	P04083	346 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	STARD3NL	O95772	234 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	G2E3	Q7L622	706 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	PDIA6	Q15084	440 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	A1BG	P04217	495 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM27	P14373	513 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYL6B	P14649	208 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	FLII	Q13045	1269 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	FKBP8	Q14318	412 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	PTPRC	P08575	1304 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	KCNQ4	P56696	695 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	ITPK1	Q13572	414 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	MS4A1	P11836	297 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPUSD1-208	ENST00000567114	APBA3	O96018	575 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	RLBP1	P12271	317 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	TJP1	Q07157	1748 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114		F6X3S4	739 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	CRBN	Q96SW2	442 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.51	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	LY75	O60449	1722 aa		32.51	■■■□□ 2.8
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLSCR1	O15162	318 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABCC4	O15439	1325 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	PROM2	Q8N271	834 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	ARX	Q96QS3	562 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-208	ENST00000567114	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADCY9	O60503	1353 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPUSD1-208	ENST00000567114	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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