RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-218	ENST00000566180	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.21	■■■□□ 2.11
RNPS1-218	ENST00000566180	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	COL15A1	P39059	1388 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	ZPR1	O75312	459 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	RIPK4	P57078	832 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	FKBP8	Q14318	412 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	GPR162	Q16538	588 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	A1BG	P04217	495 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RNPS1-218	ENST00000566180	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180		A0A087WZG4	1122 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	TM4SF1	P30408	202 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	DDR1	Q08345	913 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	YY1	P25490	414 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.08	■■■□□ 2.09	1e-9	■□□□□ 10.9
RNPS1-218	ENST00000566180	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RNPS1-218	ENST00000566180	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	TGFB2	P61812	414 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NFIX	Q14938	502 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	ANP32C	O43423	234 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RNPS1-218	ENST00000566180	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180		A0A0G2JLW4	131 aa		28	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	SERPINB2	P05120	415 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	DPEP1	P16444	411 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	APAF1	O14727	1248 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	CHL1	O00533	1208 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RNPS1-218	ENST00000566180	KCNA3	P22001	575 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	UTRN	P46939	3433 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	RGL2	O15211	777 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	CHRNA5	P30532	468 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	CFAP44	Q96MT7	982 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RNPS1-218	ENST00000566180	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	MYL6B	P14649	208 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	PDIA6	Q15084	440 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	HLF	Q16534	295 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
RNPS1-218	ENST00000566180	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.84	■■■□□ 2.05

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