RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.28■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 VPS72Q15906 364 aa22.27■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 PDE4CQ08493 712 aa22.27■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 TNS2Q63HR2 1409 aa22.27■■□□□ 1.16
GDE1-203ENST00000564172 DDB1Q16531 1140 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 GSE1Q14687 1217 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 CACNA1FO60840 1977 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 IGHDP01880 384 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 F6X3S4 739 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 USP21Q9UK80 565 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.24■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 ANXA1P04083 346 aa22.23■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.22■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 PIGBQ92521 554 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 USP16Q9Y5T5 823 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 PROSER3Q2NL68 480 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-203ENST00000564172 PDIA6Q15084 440 aa22.2■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 HYPKQ9NX55 129 aa22.19■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 C5P01031 1676 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 BCL9O00512 1426 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 PAPPAQ13219 1627 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 GLI3P10071 1580 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 AFF2P51816 1311 aa22.16■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 ATG3Q9NT62 314 aa22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 MEIS3Q99687 375 aa22.14■■□□□ 1.14
GDE1-203ENST00000564172 ITGB4P16144 1822 aa22.13■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 MYL6BP14649 208 aa22.13■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.13■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.13■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 ADCY9O60503 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 SKAP1Q86WV1 359 aa22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 KSR2Q6VAB6 950 aa22.11■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 ERBB4Q15303 1308 aa22.1■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.1■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.1■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 A0A0G2JS52 829 aa22.09■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 BEND3Q5T5X7 828 aa22.09■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 COPS6Q7L5N1 327 aa22.09■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.09■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.08■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.08■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GDE1-203ENST00000564172 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.08■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.08■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 NBPF26B4DH59 902 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 NBPF14Q5TI25 921 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 NBPF15Q8N660 670 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 A1BGP04217 495 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 USP44Q9H0E7 712 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 ATRNO75882 1429 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 ATP10DQ9P241 1426 aa22.06■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 GNAI3P08754 354 aa22.06■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 SMC5Q8IY18 1101 aa22.06■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.06■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.05■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.05■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GDE1-203ENST00000564172 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms