RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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LGMN-218ENST00000557694 C1QTNF8P60827 252 aa20.73■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 NFIXQ14938 502 aa20.73■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 MCM10Q7L590 875 aa20.73■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 COL15A1P39059 1388 aa20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 ZNF790Q6PG37 636 aa20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 BCS1LQ9Y276 419 aa20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.72■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 A1BGP04217 495 aa20.71■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
LGMN-218ENST00000557694 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.71■□□□□ 0.91
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LGMN-218ENST00000557694 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.7■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.7■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 NARFQ9UHQ1 456 aa20.7■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 TGFB2P61812 414 aa20.69■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 USP16Q9Y5T5 823 aa20.69■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.68■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.68■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.68■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 PRELPP51888 382 aa20.67■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 TEFQ10587 303 aa20.67■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.67■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.67■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.66■□□□□ 0.9
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LGMN-218ENST00000557694 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.66■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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LGMN-218ENST00000557694 CFAP53Q96M91 514 aa20.65■□□□□ 0.9
LGMN-218ENST00000557694 SCN7AQ01118 1682 aa20.64■□□□□ 0.9
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LGMN-218ENST00000557694 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 BTBD11A6QL63 1104 aa20.63■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 SERPINB2P05120 415 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.63■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 NBPF15Q8N660 670 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.61■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 CAMTA2O94983 1202 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.6■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 SBF1O95248 1867 aa20.6■□□□□ 0.89
LGMN-218ENST00000557694 BCORQ6W2J9 1755 aa20.59■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.59■□□□□ 0.89
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LGMN-218ENST00000557694 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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LGMN-218ENST00000557694 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.53■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 NFE2L2Q16236 605 aa20.52■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 HLFQ16534 295 aa20.52■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LGMN-218ENST00000557694 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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LGMN-218ENST00000557694 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.51■□□□□ 0.87
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LGMN-218ENST00000557694 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 CACNA1SQ13698 1873 aa20.5■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 RNF181Q9P0P0 153 aa20.49■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.49■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 A0A087WZG4 1122 aa20.48■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.48■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.48■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 NGEFQ8N5V2 710 aa20.47■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 KRT24Q2M2I5 525 aa20.46■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 OLFM4Q6UX06 510 aa20.46■□□□□ 0.87
LGMN-218ENST00000557694 FAM177BA6PVY3 158 aa20.45■□□□□ 0.86
LGMN-218ENST00000557694 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.45■□□□□ 0.86
LGMN-218ENST00000557694 TTLL6Q8N841 843 aa20.45■□□□□ 0.86
LGMN-218ENST00000557694 ANXA1P04083 346 aa20.44■□□□□ 0.86
LGMN-218ENST00000557694 PROSER3Q2NL68 480 aa20.44■□□□□ 0.86
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