RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.16■■□□□ 1.3
NEDD1-212ENST00000557478 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NEDD1-212ENST00000557478 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NEDD1-212ENST00000557478 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
NEDD1-212ENST00000557478 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.293e-8■□□□□ 10.5
NEDD1-212ENST00000557478 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 FKBP8Q14318 412 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 TM4SF1P30408 202 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 NFE2L2Q16236 605 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 MCM10Q7L590 875 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.11■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 C4AP0C0L4 1744 aa23.11■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 CHD4Q14839 1912 aa23.1■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 RGL2O15211 777 aa23.09■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.08■■□□□ 1.29
NEDD1-212ENST00000557478 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.07■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.07■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 DDR1Q08345 913 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 PIM2Q9P1W9 311 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.05■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 DCTN1Q14203 1278 aa23.05■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 NFIXQ14938 502 aa23.05■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 A0A0G2JLW4 131 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 KCNQ3O43525 872 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 A1BGP04217 495 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 DPEP1P16444 411 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 SERPINB2P05120 415 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 BCS1LQ9Y276 419 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 USP16Q9Y5T5 823 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-212ENST00000557478 RIPK4P57078 832 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 SETDB2Q96T68 719 aa23■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 RUNDC1Q96C34 613 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 CAMTA2O94983 1202 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 KCNA3P22001 575 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 PDE6BP35913 854 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 ERBB4Q15303 1308 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 NPHP1O15259 732 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD1-212ENST00000557478 H0YIN7 160 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ST5P78524 1137 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ADCY9O60503 1353 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 CNBD1Q8NA66 436 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 TTLL6Q8N841 843 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 ATP10DQ9P241 1426 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 SCN7AQ01118 1682 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF26B4DH59 902 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 CHRNA5P30532 468 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF15Q8N660 670 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-212ENST00000557478 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 C1QTNF8P60827 252 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 CHL1O00533 1208 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-212ENST00000557478 SOGA3Q5TF21 947 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms