RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL15A1P39059 1388 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C1QTNF8P60827 252 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PIM2Q9P1W9 311 aa18.19■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.18■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DDR1Q08345 913 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.17■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NPHP1O15259 732 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TM4SF1P30408 202 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MCM10Q7L590 875 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.16■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP10DQ9P241 1426 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C4AP0C0L4 1744 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TJP1Q07157 1748 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFIXQ14938 502 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.15■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SERPINB2P05120 415 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RALBP1Q15311 655 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHRNA5P30532 468 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 H0YIN7 160 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KCNQ3O43525 872 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A1BGP04217 495 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DCTN1Q14203 1278 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SETDB2Q96T68 719 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KCNA3P22001 575 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDE6BP35913 854 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP16Q9Y5T5 823 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADCY9O60503 1353 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFE2L2Q16236 605 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTLL6Q8N841 843 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ST5P78524 1137 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CNBD1Q8NA66 436 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CAMTA2O94983 1202 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RNF181Q9P0P0 153 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RIPK4P57078 832 aa18■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC24Q8N4L8 307 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RGL2O15211 777 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LMNB1P20700 586 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NGEFQ8N5V2 710 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CNKSR1Q969H4 720 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NBPF26B4DH59 902 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOMM70O94826 608 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NBPF15Q8N660 670 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms