RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 IQCA1Q86XH1 822 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-209ENST00000550857 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.51□□□□□ -0.89
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