RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRL2O95490 1459 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 BAG3O95817 575 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINC1P01008 464 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 USP5P45974 858 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ST5P78524 1137 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PBRM1Q86U86 1689 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 TOM1O60784 492 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 MCM3P25205 808 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 KANK3Q6NY19 840 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 MYD88Q99836 296 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NYXQ9GZU5 481 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PIK3C2GO75747 1445 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 SIL1Q9H173 461 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NEO1Q92859 1461 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FAM177BA6PVY3 158 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NAPBQ9H115 298 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NEMFO60524 1076 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 DEF6Q9H4E7 631 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 AMPD3Q01432 767 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 TMTC2Q8N394 836 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 SLC4A3P48751 1232 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FOSBP53539 338 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PDE4CQ08493 712 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 GBP3Q9H0R5 595 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ATP10AO60312 1499 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ABCC1P33527 1531 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PDE4BQ07343 736 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 NME9Q86XW9 330 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FLT4P35916 1363 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DOAP06340 250 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ANO10Q9NW15 660 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 VPS36Q86VN1 386 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ACEP12821 1306 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PLXNC1O60486 1568 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ATP2B2Q01814 1243 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 MAP3K11Q16584 847 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC181Q5TID7 509 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CERS3Q8IU89 383 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF213O14771 459 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FIBPO43427 364 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 FLIIQ13045 1269 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 GNAQP50148 359 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 KRT23Q9C075 422 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 ZSCAN12O43309 604 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRB-208ENST00000550358 B4DLN1 442 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRB-208ENST00000550358 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms