RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 NBPF26B4DH59 902 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 NBPF14Q5TI25 921 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 NBPF15Q8N660 670 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 ZNF428Q96B54 188 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 A1BGP04217 495 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-216ENST00000549221 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 RREB1Q92766 1687 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 SLC4A2P04920 1241 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ATP6V1AP38606 617 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 PROM2Q8N271 834 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 RLBP1P12271 317 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 MYL6BP14649 208 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 YY1P25490 414 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 KIF16BQ96L93 1317 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 APBA3O96018 575 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 TRIM27P14373 513 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 FLIIQ13045 1269 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 STK31Q9BXU1 1019 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ERBB4Q15303 1308 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 TXNRD1Q16881 649 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 SMIM5Q71RC9 77 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 PANK1Q8TE04 598 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 C4BP0C0L5 1744 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ADCY9O60503 1353 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 F6X3S4 739 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 PLSCR1O15162 318 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 STARD3NLO95772 234 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CACNA1FO60840 1977 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 ABCC4O15439 1325 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 TTLL7Q6ZT98 887 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 COPS6Q7L5N1 327 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 HYPKQ9NX55 129 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-216ENST00000549221 PTPRCP08575 1304 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 EIF5P55010 431 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CRBNQ96SW2 442 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ZNF827Q17R98 1081 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 COL15A1P39059 1388 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 CHD4Q14839 1912 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 GNPATO15228 680 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 PDE3AQ14432 1141 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-216ENST00000549221 KSR2Q6VAB6 950 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms